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Des cas de diarrhée aiguë, accompagnés de fièvre, abattement et baisse de production laitière ont été observés dans plusieurs départements de l’Est de la France (Doubs, Jura, Ain, deux Savoie, Isère). Dans un premier temps, la diarrhée a été rapportée comme l’élément clinique majeur et a été au centre des investigations diagnostiques. Il est apparu qu’elle était sans doute l’un des éléments cliniques d’un syndrome marqué par un épisode fébrile de courte durée (quelques jours maximum) non systématique, d’une baisse d’activité et d’une baisse temporaire mais souvent conséquente de la production laitière.

Les cas se sont multipliés ces derniers jours, rapportés par de nombreux vétérinaires dans les départements concernés. D’autres cas cliniques similaires étaient signalés en Suisse.

Sur la base des constatations épidémio-cliniques et en l’absence de détection d’agent infectieux testés en 1ère intention par les laboratoires départementaux d’analyse, des échantillons biologiques ont été adressés à l’Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT). Ces échantillons, issus de 3 élevages des Savoie (analysés sous formes de mélanges), ont été soumis à un protocole d’analyse métagénomique, qui vise à identifier des séquences génétiques retrouvées dans les échantillons et à les comparer à des bases de données mondiales.

Les données issues du séquençage par métagénomique suggèrent la détection d’un orthobunyavirus du sérogroupe Simbu apparenté au virus de Schmallenberg. L’identification d’un virus similaire a été également documentée en Suisse et en Allemagne.

Les orthobunyavirus sont des virus enveloppés à ARN. Plusieurs membres du sérogroupe Simbu, notamment les virus de Schmallenberg, Shamonda et Akabane, infectent les ruminants et sont transmis principalement par des insectes du genre Culicoides. Chez les bovins adultes, ils peuvent provoquer un syndrome aigu généralement transitoire, associant fièvre, abattement et baisse de production. Leur principal impact sanitaire est toutefois lié aux infections survenant pendant la gestation, susceptibles d’entraîner des avortements ou des malformations congénitales.

La concordance de ces découvertes laisse craindre l’émergence d’une nouvelle maladie comme la vague de la maladie de Schmallenberg apparue dans les années 2010. Il reste cependant à préciser l’impact réel de cette maladie apparue dans un contexte très défavorable (sécheresse, canicule,…) pour la santé des animaux.

La première chose à faire en cas de suspicion dans un élevage est d’écarter en première intention toutes les causes plus « conventionnelles ». Les virus de la FCO continuent de circuler, on signale également une augmentation des cas de salmonellose dans les avortements. Les messages de vigilance concernant notamment la qualité des eaux d'abreuvement restent d'actualité.

Il faut donc s’assurer de ne pas passer à côté de ces pathologies pour lesquelles une prévention est possible, ce qui ne serait hélas pas le cas pour ce nouveau virus.

Cliquer pour voir la fiche d’information (GDS France / SNGTV) à l’attention des éleveurs 

GDS BFC vous informera des avancées sur ce sujet.